计算机辅助创新药物设计平台


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计算机辅助创新药物设计平台

Platform for Drug Design

为了能在药物设计的各个阶段都提供计算机辅助，我们完成了一系列拥有自主知识产权的药物设计应用软件。与国外软件相比其最大特点是在微机和网络上运行，真正地做到了国内每个课题组都买得起与用得起。选用我们完成的全套软件，以发现新药为目的的课题组都可以从目前 in vitro → in vivo 的药物设计流程向上游扩展成 in silico → in vitro → in vivo 。
应用这一创新药物设计平台我们已成功地设计了一系列生物活性先导结构，详细情况可参见：化学学报，57(1999)，100-107，108-116；58(2000)，529-532，1074-1078，1168-1172和Chinese J. Chem., 17(1999), 237-243。

需要这一平台的用户可与我们联系。

任务 Task	起始数据 Initial Data	工作内容 Function	*ChemLab* 软件 Module	结果 Result
文献调研　 (Literature Retrieval)	化合物结构(Structures)	产生CA索引名 Generation of CA Index Name	CISOC-AGCAIN	CA索引名 CA Index Name
文献调研　 (Literature Retrieval)	关键词(Key words)	网络自动搜索 Searching in the Internet	ChemSearch	文献目录 List of Literature
未知化合物结构测定与性质计算　 Identification of Structure & Prediction of Property	IR, C NMR, H NMR, 2D NMR, MS谱	结构解析 Structure Elucidation	CISOC-SES	化合物结构 Structure
	化合物结构 Structure	IR波谱模拟 Simulation of IR	SIRS-SS	IR谱图 Spectra of IR
		C NMR波谱模拟 Simulation of CNMR	CISOC-SCNMR	C NMR谱图 Spectra of C NMR
		H NMR波谱模拟 Simulation of H NMR	CISOC-HNMR	H NMR谱图 Spectra of H NMR
		LogP预测 Prediction of LogP	CISOC-LogP	LogP值 LogP
新药研究起点　 Beginning of Drug Discovery	由症状基于中药的药物设计 Symptom	疾病检索 Disease Search	中药创新数据库 TCM Innovative Databases	疾病Disease
	由症状基于中药的药物设计 Symptom	中药方剂检索 TCM Prescription Search	中药创新数据库 TCM Innovative Databases	中药方剂，单体药，活性化合物 TCM Prescription, Medicinal Herb, Bioactive Compounds
	疾病 Diseases	药物检索 Drug Search	药物数据库 Drug Database	药物名、活性化合物结构Drug Name, Structure of Bioactive Compound
			中药创新数据库 TCM Innovative Databases	中药方剂、单体药、活性化合物 TCM Prescription, Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound
			中国天然药物资源库(在开发中)	单体药、活性化合物 Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound
			中药活性成分数据库 Bioactive Ingredient Database	活性化合物结构 Structure of Bioactive Compound
		中药方剂检索 TCM Prescription Search	中药创新数据库 TCM Innovative Databases	中药方剂、单体药、活性化合物 TCM Prescription, Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound
先导结构生成与优化　 Generation & Optimization of Lead Structures	药效团结构 Structure of Pharmacophore	自动生成小分子结构Generation of Ligands	CISOC-VCSG	虚拟活性化合物结构活性化合物结构 Structures of Virtual bioactive Compounds, Structures of bioactive Compounds
	药效团结构 Structure of Pharmacophore	3D数据库检索 3D Structure Search	CISOC-NewCom_3D
组合库设计　 Design of Combinatorial Library	疾病 Diseases	基于中药知识的组合库设计 Design of Combinatorial Library based on TCM Knowledge	中药创新数据库 TCM-Based Reverse Combinatorial Library	核心结构(Scaffold)
组合库设计　 Design of Combinatorial Library	核心结构 Scaffold	寻找最佳反应序列或反应规程 Search for Reaction Sequence or Reaction Protocol	CISOC-REACT CISOC-GRKB CISOC-RetroSYN	前体反应物(Precursors) 虚拟组合化学库(Virtual Combinatorial Library)
合成设计　 Synthesis Design	活性化合物结构 Bioactive Compounds	特定反应检索 Reaction Database	CISOC-REACT	反应 Reactions
		同类反应检索 Generic Reaction Knowledge Base	CISOC-GRKB	同类反应 Generic Reactions
		反合成分析 Retro-synthetical Analysis	CISOC-RetroSYN	合成树 Synthesis Tree

需要更进一步的介绍可通过下述地址与我们联系：

    联系人：姚建华
    联系单位：中国科学院上海有机化学研究所
              计算机化学和化学信息学研究室
    联系地址：上海市枫林路354号
    邮政编码：200032
    联系电话：+86-21-54925266, +86-21-54925264
    传真FAX ：+86-21-54925264
　

(更新时间:2017-04-20 11:28:12)

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中国科学院上海有机化学研究所计算机化学研究小组

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